在鉴别菩提根的时候，可以通过火烧法、泡水法或者摸手感进行区分，天然的菩提根通过火烧下会有一种烧糊的味道，泡水后会慢慢沉下去，表面上的纹理大小不宜。而假品经过火烧后会发出一种刺激性的气味。
1、火烧法在鉴别菩提根的真假的时候，可以通过火烧法进行辨别，天然的菩提根含有一种特殊的香味，将其放在打火机上面烘烤，会闻到木质烧焦的味道，而假的菩提根大多是以塑料的材质制成，经过火烧后容易出现刺激性气味。
2、泡水法也可以通过泡水法进行区分，天然的菩提根是植物的种子或者果实，内部的结构致密且坚硬，经过泡水后会慢慢的沉下去，而假的菩提根经过人工处理后，其内部结构遭到了破坏，泡水后会很快浮出水面。
3、摸手感也可以通过摸手感进行辨别，天然形成的菩提根上面会有很多大小不一的纹理，深浅不一，每个缝隙之间的张力也不同，摸上去会有点扎手的感觉，而假品上的纹理比较均匀，且大小一致，经过打磨后会显得比较光亮。